Bateau Mouche sur la Seine vers 1900.
Les Bateaux-Mouches doivent tout à un quartier de Lyon, à une exposition universelle, et à un entrepreneur qui comprit que Paris méritait qu'on le regarde depuis l'eau.
Les bateaux qui portent ce nom furent fabriqués à Lyon, dans le quartier de la Mouche, situé sur la rive gauche du Rhône, dans ce qui est aujourd'hui le 7e arrondissement de Lyon, non loin du Stade Gerland. Ce quartier donna son nom à ces petits bateaux rapides construits pour la navigation fluviale.
Plusieurs exemplaires furent importés à Paris pour l'Exposition universelle de 1867, où ils assurèrent le transport des visiteurs sur la Seine. Le service fit sensation. Après l'exposition, le nom resta, et l'usage du mot « bateau-mouche » se généralisa dans le langage parisien pour désigner tous les navires de promenade sur la Seine, quelle que soit leur origine.
Le 3 août 1950, Jean Bruel fonda officiellement la Compagnie des Bateaux-Mouches au 67 quai Branly, dans le 7e arrondissement. Il relança l'activité touristique sur la Seine avec les embarcations héritées de cette tradition. L'embarcadère du pont de l'Alma devint le point de départ des promenades.
La Compagnie des Bateaux-Mouches existe toujours. Elle opère depuis le même quai Branly, face à la tour Eiffel. Les navires qui y partent à toute heure ne s'appellent plus « mouches » par accident : c'est un nom de quartier lyonnais, porté par des bateaux parisiens, qu'une exposition universelle a rendu universel.
Un des rares noms de Paris qui doivent quelque chose à Lyon.